Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp10aO54827 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp10aO54827 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms