Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffbO54788 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffbO54788 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffbO54788 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffbO54788 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffbO54788 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffbO54788 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffbO54788 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffbO54788 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffbO54788 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffbO54788 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffbO54788 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DffbO54788 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffbO54788 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffbO54788 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffbO54788 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffbO54788 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffbO54788 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffbO54788 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffbO54788 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffbO54788 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffbO54788 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffbO54788 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffbO54788 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffbO54788 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffbO54788 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffbO54788 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffbO54788 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffbO54788 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffbO54788 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffbO54788 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffbO54788 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffbO54788 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffbO54788 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffbO54788 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffbO54788 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffbO54788 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffbO54788 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffbO54788 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffbO54788 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffbO54788 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffbO54788 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DffbO54788 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffbO54788 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffbO54788 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffbO54788 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffbO54788 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffbO54788 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffbO54788 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffbO54788 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffbO54788 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffbO54788 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffbO54788 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffbO54788 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffbO54788 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DffbO54788 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffbO54788 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffbO54788 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffbO54788 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffbO54788 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffbO54788 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffbO54788 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffbO54788 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DffbO54788 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffbO54788 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffbO54788 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffbO54788 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DffbO54788 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DffbO54788 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DffbO54788 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DffbO54788 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DffbO54788 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DffbO54788 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DffbO54788 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DffbO54788 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DffbO54788 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DffbO54788 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DffbO54788 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DffbO54788 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DffbO54788 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DffbO54788 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DffbO54788 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DffbO54788 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DffbO54788 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DffbO54788 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DffbO54788 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DffbO54788 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DffbO54788 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DffbO54788 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DffbO54788 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffbO54788 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffbO54788 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffbO54788 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffbO54788 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffbO54788 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffbO54788 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffbO54788 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffbO54788 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DffbO54788 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffbO54788 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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