Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EdaO54693 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EdaO54693 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EdaO54693 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EdaO54693 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EdaO54693 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EdaO54693 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EdaO54693 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EdaO54693 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EdaO54693 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EdaO54693 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EdaO54693 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EdaO54693 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EdaO54693 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EdaO54693 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EdaO54693 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EdaO54693 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EdaO54693 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EdaO54693 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EdaO54693 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EdaO54693 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EdaO54693 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EdaO54693 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EdaO54693 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EdaO54693 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EdaO54693 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EdaO54693 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EdaO54693 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EdaO54693 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EdaO54693 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EdaO54693 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EdaO54693 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EdaO54693 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EdaO54693 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EdaO54693 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EdaO54693 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EdaO54693 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EdaO54693 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EdaO54693 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EdaO54693 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EdaO54693 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EdaO54693 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EdaO54693 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EdaO54693 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EdaO54693 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EdaO54693 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EdaO54693 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EdaO54693 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EdaO54693 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EdaO54693 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EdaO54693 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EdaO54693 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EdaO54693 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EdaO54693 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EdaO54693 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EdaO54693 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EdaO54693 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EdaO54693 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EdaO54693 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EdaO54693 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EdaO54693 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EdaO54693 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EdaO54693 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EdaO54693 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EdaO54693 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EdaO54693 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EdaO54693 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EdaO54693 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EdaO54693 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EdaO54693 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EdaO54693 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EdaO54693 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EdaO54693 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EdaO54693 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EdaO54693 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EdaO54693 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EdaO54693 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EdaO54693 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EdaO54693 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EdaO54693 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EdaO54693 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EdaO54693 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EdaO54693 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EdaO54693 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EdaO54693 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EdaO54693 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EdaO54693 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EdaO54693 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EdaO54693 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EdaO54693 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EdaO54693 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EdaO54693 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EdaO54693 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EdaO54693 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EdaO54693 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EdaO54693 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EdaO54693 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EdaO54693 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EdaO54693 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EdaO54693 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms