Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccr6O54689 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms