Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nek2O35942 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nek2O35942 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nek2O35942 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nek2O35942 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nek2O35942 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nek2O35942 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nek2O35942 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nek2O35942 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms