Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Timm44O35857 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Timm44O35857 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Timm44O35857 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Timm44O35857 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Timm44O35857 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Timm44O35857 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms