Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag2O35638 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stag2O35638 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Stag2O35638 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stag2O35638 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stag2O35638 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stag2O35638 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stag2O35638 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Stag2O35638 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stag2O35638 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stag2O35638 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Stag2O35638 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stag2O35638 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stag2O35638 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stag2O35638 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Stag2O35638 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stag2O35638 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stag2O35638 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Stag2O35638 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stag2O35638 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stag2O35638 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stag2O35638 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stag2O35638 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stag2O35638 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stag2O35638 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stag2O35638 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Stag2O35638 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stag2O35638 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Stag2O35638 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Stag2O35638 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stag2O35638 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stag2O35638 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Stag2O35638 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stag2O35638 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Stag2O35638 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stag2O35638 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stag2O35638 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stag2O35638 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Stag2O35638 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stag2O35638 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Stag2O35638 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stag2O35638 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stag2O35638 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stag2O35638 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Stag2O35638 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Stag2O35638 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Stag2O35638 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Stag2O35638 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Stag2O35638 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stag2O35638 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stag2O35638 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stag2O35638 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Stag2O35638 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms