Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
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