Protein–RNA interactions for Protein: O35516

Notch2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch2O35516 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Notch2O35516 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Notch2O35516 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Notch2O35516 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Notch2O35516 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Notch2O35516 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Notch2O35516 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Notch2O35516 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Notch2O35516 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Notch2O35516 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch2O35516 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms