Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms