Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ArxO35085 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ArxO35085 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ArxO35085 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ArxO35085 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ArxO35085 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ArxO35085 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ArxO35085 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ArxO35085 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ArxO35085 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ArxO35085 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ArxO35085 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ArxO35085 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ArxO35085 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ArxO35085 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ArxO35085 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ArxO35085 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ArxO35085 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ArxO35085 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ArxO35085 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ArxO35085 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ArxO35085 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ArxO35085 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ArxO35085 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ArxO35085 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ArxO35085 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ArxO35085 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ArxO35085 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ArxO35085 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ArxO35085 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ArxO35085 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ArxO35085 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ArxO35085 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ArxO35085 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ArxO35085 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ArxO35085 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ArxO35085 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ArxO35085 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ArxO35085 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ArxO35085 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ArxO35085 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ArxO35085 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ArxO35085 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ArxO35085 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ArxO35085 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ArxO35085 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ArxO35085 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ArxO35085 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ArxO35085 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ArxO35085 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ArxO35085 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ArxO35085 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ArxO35085 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ArxO35085 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ArxO35085 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ArxO35085 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ArxO35085 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ArxO35085 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ArxO35085 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ArxO35085 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ArxO35085 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ArxO35085 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ArxO35085 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ArxO35085 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ArxO35085 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ArxO35085 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ArxO35085 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ArxO35085 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ArxO35085 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ArxO35085 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ArxO35085 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ArxO35085 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ArxO35085 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ArxO35085 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ArxO35085 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ArxO35085 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ArxO35085 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ArxO35085 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ArxO35085 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ArxO35085 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ArxO35085 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ArxO35085 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ArxO35085 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ArxO35085 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ArxO35085 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ArxO35085 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ArxO35085 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ArxO35085 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ArxO35085 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ArxO35085 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ArxO35085 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ArxO35085 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ArxO35085 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ArxO35085 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ArxO35085 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ArxO35085 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ArxO35085 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ArxO35085 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ArxO35085 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ArxO35085 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms