Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Degs1O09005 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Degs1O09005 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Degs1O09005 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Degs1O09005 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Degs1O09005 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Degs1O09005 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Degs1O09005 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms