Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcof1O08784 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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