Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CltaO08585 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CltaO08585 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CltaO08585 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CltaO08585 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CltaO08585 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CltaO08585 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CltaO08585 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CltaO08585 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CltaO08585 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CltaO08585 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CltaO08585 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CltaO08585 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CltaO08585 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CltaO08585 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CltaO08585 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CltaO08585 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CltaO08585 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CltaO08585 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CltaO08585 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CltaO08585 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CltaO08585 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CltaO08585 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CltaO08585 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CltaO08585 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CltaO08585 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CltaO08585 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CltaO08585 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CltaO08585 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CltaO08585 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CltaO08585 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CltaO08585 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CltaO08585 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CltaO08585 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CltaO08585 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CltaO08585 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CltaO08585 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CltaO08585 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CltaO08585 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CltaO08585 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CltaO08585 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CltaO08585 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CltaO08585 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CltaO08585 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CltaO08585 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CltaO08585 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CltaO08585 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CltaO08585 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CltaO08585 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CltaO08585 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CltaO08585 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CltaO08585 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CltaO08585 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CltaO08585 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CltaO08585 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CltaO08585 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CltaO08585 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CltaO08585 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CltaO08585 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CltaO08585 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CltaO08585 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CltaO08585 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CltaO08585 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CltaO08585 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CltaO08585 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CltaO08585 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CltaO08585 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CltaO08585 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CltaO08585 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CltaO08585 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CltaO08585 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CltaO08585 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CltaO08585 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CltaO08585 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CltaO08585 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CltaO08585 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CltaO08585 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CltaO08585 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CltaO08585 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CltaO08585 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CltaO08585 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CltaO08585 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CltaO08585 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CltaO08585 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CltaO08585 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CltaO08585 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CltaO08585 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CltaO08585 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CltaO08585 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CltaO08585 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CltaO08585 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CltaO08585 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CltaO08585 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CltaO08585 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CltaO08585 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CltaO08585 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CltaO08585 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CltaO08585 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CltaO08585 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CltaO08585 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms