Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efna5O08543 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efna5O08543 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efna5O08543 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efna5O08543 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efna5O08543 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efna5O08543 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efna5O08543 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Efna5O08543 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efna5O08543 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms