Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms