Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccer2J3QPU5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms