Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU0

Spin2f, Spindlin family, member 2F, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin2fJ3QPU0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spin2fJ3QPU0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spin2fJ3QPU0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms