Protein–RNA interactions for Protein: J3QPA5

Gm3099, Predicted gene 3099, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3099J3QPA5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3099J3QPA5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms