Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm20795J3QP49 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm20795J3QP49 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm20795J3QP49 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20795J3QP49 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm20795J3QP49 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm20795J3QP49 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm20795J3QP49 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm20795J3QP49 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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