Protein–RNA interactions for Protein: J3QNR8

Trim34b, Tripartite motif-containing 34B, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim34bJ3QNR8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim34bJ3QNR8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim34bJ3QNR8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms