Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim18J3QNP2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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