Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cldn34c2J3QNM1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cldn34c2J3QNM1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cldn34c2J3QNM1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cldn34c2J3QNM1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cldn34c2J3QNM1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cldn34c2J3QNM1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cldn34c2J3QNM1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cldn34c2J3QNM1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cldn34c2J3QNM1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cldn34c2J3QNM1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cldn34c2J3QNM1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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