Protein–RNA interactions for Protein: J3QN86

Gm21882, Predicted gene, 21882, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21882J3QN86 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21882J3QN86 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms