Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gm20918J3QN17 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gm20918J3QN17 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gm20918J3QN17 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gm20918J3QN17 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm20918J3QN17 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm20918J3QN17 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm20918J3QN17 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm20918J3QN17 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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