Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930544D05RikJ3QK56 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms