Protein–RNA interactions for Protein: J3QK38

Gm21244, MCG116195, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21244J3QK38 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21244J3QK38 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms