Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pot1bH7BX60 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pot1bH7BX60 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pot1bH7BX60 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms