Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17lcG5E8I7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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