Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pcf11G3X9Z4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms