Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms