Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms