Protein–RNA interactions for Protein: G3UXE9

Gm8909, Predicted gene 8909, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8909G3UXE9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8909G3UXE9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms