Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nkx1-1G3UXB3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Nkx1-1G3UXB3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nkx1-1G3UXB3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nkx1-1G3UXB3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nkx1-1G3UXB3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nkx1-1G3UXB3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nkx1-1G3UXB3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms