Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vmn1r167G3UW71 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r167G3UW71 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r167G3UW71 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r167G3UW71 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r167G3UW71 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r167G3UW71 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r167G3UW71 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r167G3UW71 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r167G3UW71 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r167G3UW71 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r167G3UW71 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r167G3UW71 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r167G3UW71 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r167G3UW71 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r167G3UW71 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r167G3UW71 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r167G3UW71 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r167G3UW71 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r167G3UW71 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r167G3UW71 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r167G3UW71 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r167G3UW71 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r167G3UW71 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r167G3UW71 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r167G3UW71 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r167G3UW71 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r167G3UW71 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r167G3UW71 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms