Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ScaperF8VQ70 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms