Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Colca2F8VPY8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms