Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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