Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arid4aF8VPQ2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arid4aF8VPQ2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arid4aF8VPQ2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arid4aF8VPQ2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arid4aF8VPQ2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arid4aF8VPQ2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arid4aF8VPQ2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arid4aF8VPQ2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arid4aF8VPQ2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arid4aF8VPQ2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arid4aF8VPQ2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arid4aF8VPQ2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arid4aF8VPQ2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arid4aF8VPQ2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arid4aF8VPQ2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arid4aF8VPQ2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arid4aF8VPQ2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arid4aF8VPQ2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arid4aF8VPQ2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arid4aF8VPQ2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Arid4aF8VPQ2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arid4aF8VPQ2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arid4aF8VPQ2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arid4aF8VPQ2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arid4aF8VPQ2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms