Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Igkv1-99F6XWB2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Igkv1-99F6XWB2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Igkv1-99F6XWB2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Igkv1-99F6XWB2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Igkv1-99F6XWB2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms