Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Crocc2F6XLV1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms