Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm17093F6XGJ4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms