Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms