Protein–RNA interactions for Protein: F6R3P9

Prl3d2, Growth hormone d5, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3d2F6R3P9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prl3d2F6R3P9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms