Protein–RNA interactions for Protein: E9QAN8

Pik3c2b, Phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2bE9QAN8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pik3c2bE9QAN8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pik3c2bE9QAN8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
Pik3c2bE9QAN8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pik3c2bE9QAN8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pik3c2bE9QAN8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pik3c2bE9QAN8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pik3c2bE9QAN8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pik3c2bE9QAN8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pik3c2bE9QAN8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pik3c2bE9QAN8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pik3c2bE9QAN8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pik3c2bE9QAN8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pik3c2bE9QAN8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pik3c2bE9QAN8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pik3c2bE9QAN8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pik3c2bE9QAN8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pik3c2bE9QAN8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pik3c2bE9QAN8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pik3c2bE9QAN8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pik3c2bE9QAN8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pik3c2bE9QAN8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pik3c2bE9QAN8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pik3c2bE9QAN8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pik3c2bE9QAN8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pik3c2bE9QAN8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pik3c2bE9QAN8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pik3c2bE9QAN8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pik3c2bE9QAN8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pik3c2bE9QAN8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pik3c2bE9QAN8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pik3c2bE9QAN8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pik3c2bE9QAN8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms