Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms