Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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