Protein–RNA interactions for Protein: E9Q956

Mcmdc2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcmdc2E9Q956 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcmdc2E9Q956 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcmdc2E9Q956 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcmdc2E9Q956 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcmdc2E9Q956 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcmdc2E9Q956 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcmdc2E9Q956 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcmdc2E9Q956 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcmdc2E9Q956 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcmdc2E9Q956 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcmdc2E9Q956 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcmdc2E9Q956 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcmdc2E9Q956 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcmdc2E9Q956 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcmdc2E9Q956 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcmdc2E9Q956 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcmdc2E9Q956 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcmdc2E9Q956 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcmdc2E9Q956 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcmdc2E9Q956 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcmdc2E9Q956 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcmdc2E9Q956 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mcmdc2E9Q956 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Mcmdc2E9Q956 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mcmdc2E9Q956 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms