Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ccdc141E9Q8Q6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms