Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Col22a1E9Q7P1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms